Ein U-Boot der japanischen Selbstverteidigungsstreitkräfte kollidiert angeblich mit einem amerikanischen Atom-U-Boot. Alle 76 Besatzungsmitglieder, darunter auch der Kommandant Shiro Kaieda, werden für tot erklärt. In Wahrheit überlebt die Crew. Der Unfall ist lediglich inszeniert worden, um die Mannschaft unbemerkt an Bord der Seabat zu bringen, einem geheimen Atom-U-Boot, das von der japanischen und amerikanischen Regierung entwickelt wurde. Kaieda rüstet die Seabat jedoch mit Atomraketen aus, meutert plötzlich und flieht.