Schimpanse Minkey und sein Partner Mike waren einst ein berühmtes Agentenduo und kein Projekt war ihnen zu gefährlich. Als Mikes Frau jedoch plötzlich starb, und er sich völlig seiner kleinen Tochter Amelia widmen musste, trennten sich die Wege der Superspione. Minkey ging zum Zirkus und Mike wurde Versicherungsvertreter. Doch zehn Jahre später wird Mikes Tochter von einem Größenwahnsinnigen entführt. Wie ihr Vater ist die zwölfjährige Amelia ein wissenschaftliches Supertalent und wird für eine ihrer Entdeckungen, einen chemischen Laser-Spezialbohrer, ausgezeichnet. Ausgerechnet ihr großes Vorbild, der weltberühmte Wissenschaftler Dr. Farley, bringt Amelia unter einem Vorwand nach Japan. Dort will er mit ihrer Hilfe den Bohrer in gigantischer Größe nachbauen, um so an die Energie im innersten Kern der Erde zu gelangen. Dieses Experiment birgt aber das Risiko eines weltumfassenden verheerenden Erdbebens in sich. Für ein letztes Mal wollen sich Minkey und Mike nun wieder in eine gemeinsame abenteuerliche Mission stürzen. Sie müssen Amelia und die Welt retten! Minkey ist dabei nicht nur ein unschlagbarer Meister in Kung-Fu, am Trapez und im Klettern, sondern auch ein liebenswerter Spaßvogel.