Sein Kinodebüt gab Scott 1994 in Caroline Thompsons Tierabenteuerfilm "Black Beauty", gefolgt von der Historienkomödie "Prinzessin Caraboo". Nach diesem kurzen Kinogastspiel kehrte der Darstelle zunächst zum Fernsehen zurück und spielte in so unterschiedlichen Filmen wie "Expedition in die Geisterschlucht" und "The Crow Road" (beide 1996). Anschließend war er in Anne Goursauds Softporno-Käse "9 1/2 Wochen in Paris" (1996) neben Mickey Rourke zu sehen, bevor ihn Kevin Allen in seiner schwarzen Komödie "Twin Town - Das Chaoten-Kaff" (1997) besetzte. Mit Gillies MacKinnons TV-Porträt "Der Preis der Ehre" (1997) folgte ein sehenswerter TV-Film an der Seite von Jonathan Pryce und Jonny Lee Miller, während der romantische Liebesfilm "Auf immer und ewig" (1998) die männliche Hauptrolle neben Drew Barrymore bereithielt. Nicht schlecht war auch die Komödie "Lover oder Loser" (1999) mit Ian Hart und Catherine McCormack und der gekonnt inszenierte Märchen-Episodenfilm "Arabian Nights - Abenteuer aus 1001 Nacht" (2000).
Scotts nächster Filmpartner war Tom Cruise in dem Actioner "Mission: Impossible II", in dem der Mime den Bösewicht verkörperte, die Titelhelden gab er dagegen in Michel Apteds spannendem Thriller "Enigma - Das Geheimnis" (2001) und in dem Drama "Der Poet" (2003). Zwei Jahre sah man Scott mit Jennifer Connelly in dem nur teilweise gelungenen Thriller "Dark Water - Dunkle Wasser", bevor er 2006 in dem Bibelfilm "Die Zehn Gebote" als Moses überzeugte. Im gleichen Jahr verkörperte er sechs Folgen lang den Mickey O'Neil in der Krimiserie "Heist", weitere Serienerfahrung sammelte er auch als Ian Hainsworth in der populären US-Serie "Desperate Housewives" (2006/2007).
Weitere Filme mit Dougray Scott: "Magic Moments" (1996), "Deep Impact" (1998), "Gregory's Two Girls" (1999), "Ripley's Game", "Aus Lust und Liebe" (beide 2002), "To Kill a King" (2003), "One Last Chance", "Things to Do Before You're 30", "Essential Poems for Christmas" (alle 2004), "Perfect Creature" (2005), "Hitman - Jeder stirbt alleine" (2007), "My Week with Marilyn" (2011).